'Vroeger' (in de tijd van MU) moet je plugins nog beschikbaar stellen voor het hele netwerk. Tegenwoordig gaat dat automatisch. Er zijn zelfs plugins om het weer op de oude manier te laten lopen:
http://wordpress.org/extend/plugins/multisite-plugin-manager/
Kijk eens door dit draadje. Misschien levert dat nog een idee op:
http://wordpress.org/support/topic/activating-plugins-in-multisite?replies=23